Le sanctuaire de Saint Pio de Pietrelcina reçoit plus de huit millions de visiteurs chaque année, ce qui en fait l'une des destinations de pèlerinage les plus visitées d'Europe après Lourdes.
Construite entre 2004 et 2008, l'église moderne conçue par Renzo Piano accueille six mille fidèles sous une coque de pierre et de cuivre qui évoque à la fois la forme en spirale d'un nautile et les villages de montagne traditionnels de la péninsule du Gargano. Le sanctuaire se dresse sur le site à flanc de colline où Padre Pio a vécu et exercé son ministère pendant un demi-siècle, portant les stigmates de 1918 jusqu'à sa mort en 1968. Son tombeau se trouve dans la crypte sous l'église supérieure, enfermé dans une chapelle de marbre de Carrare et de bronze, visité en silence par des pèlerins qui arrivent chaque jour de toute la Méditerranée et d'Amérique latine.
Le complexe préserve également l'ancienne Chiesa di Santa Maria delle Grazie, l'église du couvent des Capucins du XVIe siècle où Padre Pio célébrait la messe et confessait dans une cabine en bois toujours visible derrière une vitre de protection. Adjacent au nouveau sanctuaire, le chemin extérieur du Via Crucis serpente à travers des cyprès et des oliviers indigènes, avec ses stations en bronze sculptées par Francesco Messina. Les options d'excursion d'une journée à Padre Pio au départ de Rome combinent généralement la visite du sanctuaire avec le Santuario di San Michele Arcangelo à Monte Sant'Angelo, un site classé au patrimoine mondial de l'UNESCO situé à vingt-cinq kilomètres au nord, où les pèlerins descendent dans la grotte calcaire depuis le Ve siècle. L'archange Michel serait apparu dans la grotte en 490 après J.-C., et le site est devenu une étape sur la Via Sacra Longobardorum, la route de pèlerinage médiévale reliant les sanctuaires lombards à travers le sud de l'Italie.
San Giovanni Rotondo elle-même s'est transformée d'un village agricole de quatre mille habitants en 1916 en une ville de pèlerinage moderne après la canonisation de Padre Pio en 2002. La Casa Sollievo della Sofferenza, un hôpital universitaire fondé par Padre Pio en 1956, sert désormais de l'un des plus grands centres médicaux des Pouilles. Les visiteurs réservant un pèlerinage guidé au départ de Rome parcourent environ trois cent soixante kilomètres dans chaque sens, traversant du Latium vers le Molise jusqu'au nord des Pouilles, la plupart des circuits quittant la capitale avant l'aube pour permettre suffisamment de temps au sanctuaire et à la grotte de Saint-Michel-Archange avant le voyage de retour.
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