Il Santuario di San Pio da Pietrelcina accoglie oltre otto milioni di visitatori ogni anno, rendendolo una delle destinazioni di pellegrinaggio più visitate d'Europa dopo Lourdes.
Costruita tra il 2004 e il 2008, la chiesa moderna progettata da Renzo Piano accoglie seimila fedeli sotto una copertura di pietra e rame che evoca sia la forma a spirale di un nautilus che i tradizionali villaggi di montagna della penisola del Gargano. Il santuario sorge sul sito collinare dove Padre Pio visse e operò per mezzo secolo, portando le stimmate dal 1918 fino alla sua morte nel 1968. La sua tomba si trova nella cripta sotto la chiesa superiore, racchiusa in una cappella di marmo di Carrara e bronzo, visitata in silenzio dai pellegrini che arrivano quotidianamente da tutto il Mediterraneo e dall'America Latina.
Il complesso conserva anche la vecchia Chiesa di Santa Maria delle Grazie, la chiesa del convento dei Cappuccini del XVI secolo dove Padre Pio celebrava la messa e confessava in un confessionale di legno ancora visibile dietro una protezione di vetro. Adiacente al nuovo santuario, il percorso esterno della Via Crucis si snoda tra cipressi e uliveti, con stazioni in bronzo scolpite da Francesco Messina. Le opzioni per il tour giornaliero di Padre Pio da Roma solitamente combinano la visita al santuario con il Santuario di San Michele Arcangelo a Monte Sant'Angelo, un sito patrimonio dell'umanità UNESCO a venticinque chilometri a nord, dove i pellegrini scendono nella grotta calcarea fin dal V secolo. Si narra che l'arcangelo Michele sia apparso nella grotta nel 490 d.C. e il sito divenne una tappa della Via Sacra Longobardorum, il percorso di pellegrinaggio medievale che collegava i santuari longobardi in tutto il sud Italia.
San Giovanni Rotondo si è trasformato da un villaggio agricolo di quattromila residenti nel 1916 in una moderna città di pellegrinaggio in seguito alla canonizzazione di Padre Pio nel 2002. La Casa Sollievo della Sofferenza, un ospedale di insegnamento fondato da Padre Pio nel 1956, oggi funge da uno dei più grandi centri medici della Puglia. I visitatori che prenotano un pellegrinaggio guidato da Roma coprono circa trecentossessanta chilometri per tratta, attraversando il Lazio, il Molise e arrivando nel nord della Puglia, con la maggior parte dei tour che partono dalla capitale prima dell'alba per consentire tempo sufficiente sia al santuario che alla grotta di San Michele Arcangelo prima del viaggio di ritorno.
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